С целью создания системы воспитательной деятельности, эффективной для формирования активной, социально ответственной, всесторонне развитой личности специалиста, востребованного на рынке труда, в академии разработана и утверждена «Концепция воспитательной работы ФГОУ ВО Костромской ГСХА».
В феврале 2011 года был выделен как самостоятельное структурное подразделение отдел по воспитательной и социальной работе, с 1 октября 2016 года переименован в управление по воспитательной и социальной работе.